关于银行合并后存款超过50万怎么赔的问题，首先我要明确的是，银行合并本身通常不会直接导致对存款人的赔偿。合并后的银行会承接原银行的所有债权债务关系，包括存款人的存款。因此，存款人的存款在合并后仍然安全，不会因为合并而受到影响或需要赔偿。
1. 存款安全不受影响：银行合并是一个正常的商业行为，通常是在监管机构的监督下进行的。合并后的银行会继承原银行的所有资产和负债，包括客户的存款。因此，从法律上讲，存款人的存款并没有因为银行的合并而受到影响，也就不存在赔偿的问题。
2. 存款保险制度保障：此外，我国实行存款保险制度，对于在银行中的存款，有一定的保险保障。即使银行出现风险或破产，存款保险制度也能在一定程度上保护存款人的利益，但这与银行合并是两个不同的概念。
3. 特殊情况处理：当然，也存在一些特殊情况，比如合并过程中出现了操作失误或违规行为，导致存款人的存款受到了损失。在这种情况下，存款人可以依法向银行提出索赔要求，并寻求法律途径来维护自己的权益。但这并不是银行合并本身所导致的赔偿问题，而是具体的法律纠纷。
综上所述，银行合并后，存款人的存款超过50万并不会直接导致赔偿。存款人的存款在合并后仍然安全，且受到存款保险制度的保障。如果合并过程中出现了导致存款损失的特殊情况，存款人可以依法向银行提出索赔要求。如果您还有其他法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。