在婚姻家庭法律关系中，确认亲子关系并不受一方是否在服刑的限制。如果女方有充分的理由和证据需要确认亲子关系，她完全有权向法院提出相关的申请。法院会根据实际情况，包括证据的有效性、亲子鉴定的可能性等因素，来审理并作出判决。
具体来说，确认亲子关系通常需要通过亲子鉴定等科学手段来进行。如果男方在服刑期间，亲子鉴定可能需要特别的安排，比如在监狱内进行采样等。但这并不影响女方提出确认亲子关系的权利，以及法院对此类案件的审理。
总之，无论男方是否在服刑，女方都有权向法院提出确认亲子关系的申请。法院会依法进行审理，并根据实际情况作出判决。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。