首先，我们需要明确的是，借条上的“3年有效期”实际上指的是诉讼时效期间。根据《民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一期限从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。超过这一期限，并不意味着债权人完全丧失了起诉权，而是可能因对方以时效已过抗辩而丧失胜诉权。
具体来说，如果借条超过3年诉讼时效，债权人仍然可以向法院提起诉讼。法院在受理案件时，会审查是否存在诉讼时效中断、中止等情形。若期间有中断、中止情形的，诉讼时效可重新计算。如果对方未提出时效抗辩，法院仍可审理；若对方提出时效抗辩，且法院审查确认无时效中断、中止等情形，则可能会驳回原告的诉讼请求，即债权人可能败诉。
因此，在考虑起诉之前，债权人需要仔细评估是否存在诉讼时效中断、中止等情形，并尽可能收集相关证据以证明自己的权益。这些证据可以包括催收通知、短信记录、通话记录、证人证言等，用于证明在诉讼时效期间内向债务人主张过权利或存在其他导致诉讼时效中断、中止的法定事由。
总之，借条超过3年有效期仍然可以起诉，但债权人需要充分了解诉讼时效的相关规定，并尽可能收集证据以证明自己的权益。如果在实际操作中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。