首先，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。但这一规定并不影响债权人的起诉权，即债权人仍有权向法院提交起诉状和相关证据，启动诉讼程序。然而，如果债权在三年内未得到主张，且不存在诉讼时效中断或中止的情形，债务人可以提出诉讼时效抗辩，法院也可能因此驳回债权人的诉讼请求。
具体来说，若借条超过三年，但在这期间债权人曾向债务人主张过权利，如通过聊天记录、催款函等方式催要过欠款，那么诉讼时效就会从此时重新开始计算。这种情况下，即使借条已经超过三年，债权人起诉仍然有效，因为诉讼时效已经中断并重新计算。
另外，即使借条超过三年，只要起诉符合法院受理的条件，法院仍然会受理该案件。进入诉讼程序后，若被告未以诉讼时效已过进行抗辩，法院不会主动适用诉讼时效规定进行裁判，债权人仍有可能通过法院判决实现债权。
因此，对于已经超过三年的借条，债权人在考虑起诉前应仔细评估案件情况、证据是否充分以及是否存在诉讼时效抗辩的风险。若存在诉讼时效中断或中止的证据，应及时收集并向法院提供，以增加胜诉的可能性。同时，也建议债权人在借款发生后及时主张权利，避免因诉讼时效问题给自己带来不利影响。
总之，虽然借条超过三年起诉仍然有效，但债权人需要充分准备并评估风险，以确保自己的权益得到最大程度的保护。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。